面对自然灾害来袭，行动最快、走在最前的是工会组织。1985年4月，阿城、呼兰遭受水灾。市总工会拨款20万元，动员全市职工捐款1086612元、衣物746026件、粮票12643570斤、粮食4810斤，帮助 877户受灾职工重建家园、解脱困境。1987年5月，大兴安岭林区发生火灾，市总工会和基层工会筹款35万元支援灾区。同年7月，呼兰遭受龙卷风，500户职工受灾，市总工会拨款2万元救济。

　　2002年4月，哈尔滨市部分地区遭受自然灾害，市总工会立即举行全市工会系统“扶贫济困送温暖”大型募捐活动，为宾县、方正县、依兰县等地受灾群众募捐。短短8天各级工会发动群众捐款人民币35万元；生活用品、衣物等25万件，原煤50吨、米面36吨、生产物资3000余件，折合人民币325万元；款物总计360万元。

　　2008年5月12日，四川汶川地区发生重大地震灾害，14日，哈尔滨市总工会下发《关于在全市各级工会组织和广大职工中开展支援汶川等地震灾区救灾工作的紧急通知》，全市各级工会组织、工会干部和广大职工积极投身抗震救灾工作。市总工会举全会之力，抽调人员分成8个工作组，与基层工会沟通联络，确保捐赠工作顺利有序进行。5月16日，市总工会举行了全市工会系统抗震救灾捐助仪式，市总工会机关干部、基层工会组织、工会干部、劳模单位、劳动模范代表和职工群众代表踊跃捐款。哈尔滨工业资产经营有限责任公司等二十一个单位和部分劳模代表捐款总计200余万元。5月23日，哈尔滨投资集团向四川地震灾区捐赠羽绒服、毛巾被300条、棉被共计2410件，折合人民币43.1万元。5月29日，市总工会机关全体在职党员和部分离退休党员共缴纳特殊党费19.5万元，三次捐款总计达22.9万元。5月29日，市总工会和南岗区总工会在海城小学以“共享阳光，共建家园”为主题，慰问了四川灾区到该校就读的10名学生。市总工会出资100万元重建了因地震损坏的陕西勉县二道河乡中心小学。2009年11月18日，经过半年的紧张施工建设，哈尔滨市总工会对口帮扶援建的“哈尔滨工会·二道河中心小学”教学楼落成暨竣工仪式在新落成的教学楼前隆重举行。